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METTL14通過m6A依賴方式調(diào)控初始miR-375的加工抑制結(jié)直腸癌的進(jìn)展
2020.03.06
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一、研究背景

? ? ? ?結(jié)直腸癌(CRC)是世界上第三常見的癌癥和第四致命的惡性腫瘤。雖然在過去的幾十年里,手術(shù)聯(lián)合系統(tǒng)治療已經(jīng)改善了CRC患者的預(yù)后,但腫瘤復(fù)發(fā)和肝轉(zhuǎn)移在CRC患者中仍然很常見,且與較差的生存率密切相關(guān)。因此,更好地理解CRC啟動(dòng)和進(jìn)展的機(jī)制是至關(guān)重要的。


? ? ? ?目前已有100多種RNA修飾的報(bào)道,其中4-6種為n6 -甲基ladenosine (m6A)修飾,是真核mRNAs中最常見的內(nèi)修飾。這種修飾的失調(diào)與人類疾病,包括惡性腫瘤密切相關(guān)。在哺乳動(dòng)物中,RNA既可以在甲基化轉(zhuǎn)移酶(METTL3、METTL14、WTAP)的作用下發(fā)生m6A甲基化修飾,又可以在FTO、ALKBH5等酶的作用下發(fā)生去甲基化修飾。近年來,越來越多的研究結(jié)果表明,m6A是一種關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄后修飾,調(diào)控mRNA和非編碼RNA的生物學(xué)過程。


? ? ? ? 據(jù)報(bào)道[2],METTL3的缺失降低了DGCR8與初級microRNAs (primiRNAs)的結(jié)合,并導(dǎo)致成熟microRNAs的減少。同時(shí),有研究發(fā)現(xiàn)METTL14與DGCR8相互作用,并以一種依賴于m6a的方式正向調(diào)控初始miR-126 (primiR-126)成熟過程[3]。

二、研究結(jié)果

1、METTL14在CRC組織和細(xì)胞系中下調(diào),且與患者總生存率相關(guān)


? ? ? ?作者首先檢測了CRC組織和細(xì)胞系中METTL14的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn),與FHC(正常結(jié)腸上皮細(xì)胞)相比,在CRC細(xì)胞中檢測到較低水平的METTL14;與此類似,檢測112對CRC組織和ANTs(癌旁組織),發(fā)現(xiàn)CRC組織中METTL14的水平低于ANTs;同時(shí),METTL14的表達(dá)下降與CRC進(jìn)展相關(guān)。


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2、METTL14抑制CRC細(xì)胞增殖、遷移和侵襲


? ? ? ?接下來,為了探究m6A修飾對CRC發(fā)生和發(fā)展的影響,作者在HCT116 和 HCT8 細(xì)胞中敲降METTL14,隨后檢測細(xì)胞整體m6A水平和細(xì)胞活力。結(jié)果發(fā)現(xiàn),敲降METTL14后,兩株細(xì)胞m6A水平下降,細(xì)胞增殖活性顯著上升;同時(shí),檢測細(xì)胞周期,結(jié)果發(fā)現(xiàn)敲降METTL14后,細(xì)胞S期比列顯著增加。


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? ? ? ?為了進(jìn)一步確認(rèn)METTL14對CRC細(xì)胞增殖的影響,作者同時(shí)在HCT116 和 HCT8 細(xì)胞中過表達(dá)METTL14,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,過表達(dá)METTL14后,細(xì)胞m6A水平上升,細(xì)胞增殖被抑制,G0/G1期細(xì)胞數(shù)增多,S期細(xì)胞數(shù)下降。


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? ? ? ? 隨后,探討METTL14對CRC細(xì)胞遷移和侵襲的作用。實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),敲降METTL14后,HCT116和HCT8細(xì)胞的遷移和侵襲能力均有顯著提高;與此相反,過表達(dá)METTL14明顯抑制CRC細(xì)胞的遷移和侵襲。


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3、METTL14抑制體內(nèi)CRC的生長和轉(zhuǎn)移


? ? ? ? 接下來,作者進(jìn)一步探究METTL14在體內(nèi)的作用。首先在HCT116細(xì)胞中分別構(gòu)建了METTL14敲降和過表達(dá)穩(wěn)轉(zhuǎn)株細(xì)胞,然后用這兩種細(xì)胞構(gòu)建了皮下異種移植模型。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,METTL14敲降的異種移植瘤的生長明顯受到促進(jìn),而METTL14過表達(dá)的移植瘤生長明顯受到了抑制;同時(shí),免疫組化實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,METTL14敲降增加了Ki67的表達(dá),而METTL14過表達(dá)降低了異種移植組織中Ki67的表達(dá)水平。


? ? ? ? 此外,通過尾靜脈注射HCT116細(xì)胞,建立裸鼠肺轉(zhuǎn)移瘤模型。結(jié)果顯示,METT14敲降組明顯促進(jìn)肺擴(kuò)張,而METTL14過表達(dá)組明顯抑制肺轉(zhuǎn)移。


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4、DGCR8通過依賴于METTL14的m6A甲基化調(diào)控miR-375


? ? ? ?前面我們講到,越來越多的研究證實(shí)METTL3或METTL14是DGCR8參與各種癌癥的primiRNAs所必需的。作者因此探究在CRC中,DGCR8調(diào)控primiRNA的過程是否依賴于METT14/m6A。


? ? ? ?鑒于m6A水平的降低會(huì)導(dǎo)致primiRNA的過程停滯,并導(dǎo)致相應(yīng)miRNA水平的降低,因此,METTL14/ m6a依賴的miRNA的表達(dá)與METTL14表達(dá)正相關(guān);作者使用TCGA數(shù)據(jù)庫分析網(wǎng)站LinkedOmics (http://www.linkedomics.org/login.php),發(fā)現(xiàn)9個(gè)miRNA在CRC組織中發(fā)現(xiàn)與METTL14呈正相關(guān);隨后,在METTL14敲降細(xì)胞株中檢測這些miRNA的表達(dá),發(fā)現(xiàn)miR-375和miR-200a表達(dá)下降,進(jìn)一步檢測兩個(gè)miRNA前體形式primiR-375和primiR-200a 的表達(dá),實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),primiRNA-375在METTL14敲降的CRC細(xì)胞中積累,在METTL14過表達(dá)的CRC細(xì)胞中下調(diào),而primiR-200a沒有明顯變化。


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? ? ? ?為了驗(yàn)證m6A修飾在primiR-375成熟過程中的直接作用,接下來,作者把其m6A修飾的位點(diǎn)突變,結(jié)果發(fā)現(xiàn),primiR-375中m6A motif的突變顯著地降低了其向成熟形態(tài)的加工。此外,免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,primiR-375與DGCR8結(jié)合的水平在METTL14過表達(dá)細(xì)胞中顯著上升,同時(shí),METTL14過表達(dá)明顯增加了primiR-375 的m6A修飾水平。


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5、miR-375是METTL14的下游靶點(diǎn)


? ? ? ?隨后,作者進(jìn)一步探討miR-375作為METTL14的下游靶點(diǎn),在CRC進(jìn)展中的潛在分子機(jī)制,作者檢測112對CRC組織和ANTs(癌旁組織)中miR-375的表達(dá)情況,結(jié)果顯示,與相應(yīng)的ANTs相比,CRC組織中miR-375明顯降低,與METTL14呈正相關(guān),且其下調(diào)與預(yù)后不良有關(guān)。

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? ? ? ?接下來,在METTL14過表達(dá)細(xì)胞中使用miR-375 inhibitor,下調(diào)miR-375的表達(dá);并且發(fā)現(xiàn)抑制miR-375可以恢復(fù)細(xì)胞下降的增殖、遷移和侵襲能力;類似的,在METTL14敲降細(xì)胞中上調(diào)miR-375的表達(dá),以及一系列的回復(fù)實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),mir -375的表達(dá)能夠逆轉(zhuǎn)METTL14敲低對細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響。


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6、METTL14通過miR-375/YAP1和miR-375/SP1通路抑制CRC進(jìn)展


? ? ? ?眾所周知,miR-375是一種重要的癌癥相關(guān)miRNA,許多致癌基因已被證實(shí)為miR-375的功能靶點(diǎn),包括YAP1、SP1、AEG1、PDK1、IGF1R和JAK2。

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? ? ? ?在這里,我們發(fā)現(xiàn)METTL14過表達(dá)明顯升高miR-375的表達(dá),并且降低YAP1和SP1的表達(dá),免疫組化結(jié)果與此一致,而METTL14敲降增加了異種移植組織中YAP1和SP1的表達(dá)水平。因此,作者推測METTL14可能通過miR-375/YAP1和miR-375/SP1通路發(fā)揮其生物學(xué)功能。為了驗(yàn)證這個(gè)假設(shè),作者使用熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)檢測miR-375和其下游靶標(biāo)的結(jié)合關(guān)系,在293T 和 HCT116 細(xì)胞中,過表達(dá)miR-375后,WT組熒光水平下降,而MUT組熒光水平不變;

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? ? ? ?此外,作者在METTL14過表達(dá)細(xì)胞中轉(zhuǎn)入YAP1和SP1過表達(dá)質(zhì)粒,并進(jìn)行了一系列的回復(fù)實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,YAP1提高了細(xì)胞的增殖能力,SP1提高了細(xì)胞的遷移和侵襲能力。這些結(jié)果表明METTL14通過miR-375/YAP1和miR-375/SP1通路抑制CRC進(jìn)展。


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結(jié)語

? ? ? ?METTL14在CRC組織和細(xì)胞系中下調(diào),并且與總生存率(OS)密切相關(guān)。METTL14的下調(diào)顯著降低了總RNA中m6A的水平,促進(jìn)了CRC細(xì)胞的生長和轉(zhuǎn)移,而METTL14的過表達(dá)則顯著提高了總RNA中m6A的水平,并起到抑制CRC細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移的作用。此外,作者證實(shí)了miR-375是METTL14的下游靶點(diǎn)。并且,METTL14通過miR-375/YAP1通路抑制CRC細(xì)胞生長,以及通過miR-375/SP1通路抑制CRC細(xì)胞的遷移和侵襲。


參考文獻(xiàn):

?1. Chen Xiaoxiang,Xu Mu,Xu Xueni et al. METTL14 Suppresses CRC Progression via Regulating N6-Methyladenosine-Dependent Primary miR-375 Processing.[J] .Mol. Ther., 2020, 28: 599-612.

2. Alarcón, C.R., Lee, H., Goodarzi, H., Halberg, N., and Tavazoie, S.F. (2015). N6-

methyladenosine marks primary microRNAs for processing. Nature 519, 482–485.

?3. Ma, J.Z., Yang, F., Zhou, C.C., Liu, F., Yuan, J.H., Wang, F., Wang, T.T., Xu, Q.G.,

Zhou, W.P., and Sun, S.H. (2017). METTL14 suppresses the metastatic potential of

hepatocellular carcinoma by modulating N 6 -methyladenosine-dependent primary

MicroRNA processing. Hepatology 65, 529–543.


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