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全新工具-新藥篩選網(wǎng)站上線了
2019.12.02
1536次

? ? ? 各位HYY的忠實小伙伴,博士苑專業(yè)提供醫(yī)學(xué)科研解決方案,一直致力提供更好的服務(wù)給廣大醫(yī)學(xué)科研人員,不斷豐富HYY自身實力。


? ? ? 2018年4月,HYY有幸參與到廣州市第一人民醫(yī)院、中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院、中山大學(xué)、中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院聯(lián)合承擔(dān)的廣州市協(xié)同創(chuàng)新重大專項計劃:泌尿系腫瘤大數(shù)據(jù)人工智能精準(zhǔn)診療新技術(shù)研究及應(yīng)用的課題研究中。


? ? ? 自項目立項起,HYY就開始了新藥篩選網(wǎng)站及基因藥物數(shù)據(jù)庫的籌備工作,經(jīng)過近1年的項目開發(fā),網(wǎng)站今天終于完成上線,下面就對網(wǎng)站功能進(jìn)行全面介紹。



? ? ? 本網(wǎng)站旨在從基因靶標(biāo)出發(fā),獲得先導(dǎo)化合物和新藥,是為科研人員量身打造的新藥開發(fā)轉(zhuǎn)化支撐服務(wù)的平臺。



獲取更多資訊歡迎訪問

http://www.gene2newdrug.com

(點擊閱讀原文訪問)


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新藥篩選平臺


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網(wǎng)站功能一:基因與藥物數(shù)據(jù)庫查詢



? ? ? ?本站提供的藥物-基因關(guān)系數(shù)據(jù)來源于四大常用數(shù)據(jù)庫:Comparative Toxicogenomics Database(CTD,version 2019.6),The Drug Gene Inter-action database(DGIdb,version 3.0.2),DrugCentral(version 10.4)、 Guide to Pharmacology(version 2019.3)。對于每一對藥物-基因,本站提供了藥物CAS編號、基因Entrez ID、基因所屬物種、作用類型、參考文獻(xiàn)、數(shù)據(jù)來源等信息, 用戶可利用關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索和下載。

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? ? ? ?在輸入框輸入想要查詢的基因名稱或者基因ID,或者藥物名稱。得到檢索列表,網(wǎng)站提供下載功能。


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網(wǎng)站功能二 :靶點篩選



? ? ? ?文庫篩選:CRISPR/Cas9系統(tǒng)是當(dāng)今基因編輯領(lǐng)域最熱門的明星工具,2013年,Broad研究所的兩個研究團(tuán)隊分別在Science雜志同一期上發(fā)表了CRISPR文庫的相關(guān)研究。在此之后,基于CRISPR/Cas9的工具得到了快速發(fā)展,CRISPRa,CRISPRi及CRISPR敲除文庫已經(jīng)廣泛用于證明新的生物學(xué)機制,如耐藥性和細(xì)胞存活信號。多篇CNS(Cell、Nature、Science)連續(xù)報道。利用該技術(shù),研究人員在藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)、基因功能研究、藥物敏感基因研究等領(lǐng)域取得了巨大的成功。

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網(wǎng)站功能三:在線新藥虛擬篩選



計算機輔助藥物設(shè)計

? ? ? 在分子層面上理解藥物分子與靶點的作用,提供了一種 快速、低廉的 虛擬篩選方案,在先導(dǎo)藥物發(fā)現(xiàn)中效果顯著。分子對接技術(shù)(藥物設(shè)計的最重要的方法之一 )Fisher E提出的“鎖和鑰匙模型”。即受體與配體的相互識別首要條件 是空間結(jié)構(gòu)的匹配 。

? ? ? 在線新藥虛擬篩選模塊:人工智能、超級計算大大提升了新藥研發(fā)速度,網(wǎng)站提供任務(wù)在線提交,在線支付功能。使用天河二號15萬個CPU核,耗時0.5小時,可進(jìn)行75萬個小分子化合物的結(jié)合親和力評估。歡迎大家使用體驗。

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網(wǎng)站功能四:技術(shù)服務(wù)列表



? ? ? 有了藥物和靶點,想要做實驗驗證,博士苑提供完整技術(shù)平臺完成藥物驗證工作。技術(shù)服務(wù)列表:

? ? ? 過表達(dá)載體構(gòu)建、抑制載體構(gòu)建、定點突變、q-PCR、原代細(xì)胞分離及培養(yǎng)、細(xì)胞瞬轉(zhuǎn)、慢病毒包裝、穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建、單克隆細(xì)胞株、CCK8、Transwell、劃痕實驗、克隆形成實驗、流式凋亡、流式周期、雙熒光素基因報告實驗、動物飼養(yǎng)(大、小鼠,兔子)、 人類疾病動物模型制作、動物給藥、觀察及取材、 藥效評價研究、毒理學(xué)研究、生理、生化指標(biāo)檢測、HE染色;免疫組化(IHC)、 細(xì)胞凋亡檢測TUNEL;原位雜交ISH;透射電鏡TEM;Masson

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網(wǎng)站功能五:成功案例分享



? ? ? ?納米藥物載體被譽為“生物導(dǎo)彈”,這一給藥系統(tǒng)是腫瘤治療最有前景的研究方向之一。納米藥物載體材料表面具有豐富的正電荷及氨基,可以偶聯(lián)特異性分子,例如DNA、RNA、iRNA,藥物分子等。表面修飾后的納米藥物進(jìn)入血液循環(huán)以后,與腫瘤細(xì)胞表面受體發(fā)生特異性結(jié)合,藥物釋放于腫瘤組織內(nèi)部, 實現(xiàn)藥物于腫瘤組織更高效率的靶向蓄積。


? ? ? ?納米載體藥物遞送系統(tǒng)具有時間和空間優(yōu)勢。在時間上,納米材料能夠改變藥物釋放速率, 包括對于難溶性藥物的增溶作用及對于藥物的緩釋作用; 從空間上,納米材料能夠改變藥物的體內(nèi)分布, 使藥物在靶器官組織蓄積,減小對非靶向器官和細(xì)胞的毒副作用。?


? ? ? ?應(yīng)用:納米藥物載體、基因載體、光熱治療

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? ? ? ?胞內(nèi)氯離子通道蛋白l ?(CLICl)在多種惡性腫瘤中如肺癌、宮頸癌、肝癌、乳腺癌、結(jié)腸癌、胃癌和膽囊癌中均有不同程度的高表達(dá)。有研究證實 CLICl 與惡性腫瘤的化學(xué)藥物治療和放射治療的抵抗有明顯的相關(guān)性。CLICl 有可能成為癌癥診斷治療和預(yù)后監(jiān)測的腫瘤標(biāo)記物或藥物治療、基因干預(yù)的靶分子,在臨床實踐中發(fā)揮作用。


? ? ? ?研究思路:靶點結(jié)構(gòu)分析,中藥(TCM)數(shù)據(jù)庫虛擬篩選,Top30 分子動力學(xué)模擬,Top6 hits 結(jié)合模式分析。

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網(wǎng)站功能六:資料下載



? ? ? ?本著開放共享,學(xué)習(xí)共贏的態(tài)度,我們提供藥物設(shè)計、藥物研發(fā)相關(guān)的學(xué)習(xí)課件和軟件安裝包的下載,內(nèi)容不斷豐富,方便廣大客戶下載學(xué)習(xí)。

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廣州輝園苑醫(yī)藥科技有限公司



? ? ? ?廣州輝園苑醫(yī)藥科技有限公司成立于2014年,總部坐落于美麗的廣州國際生物島, 是一家專注于生物醫(yī)藥技術(shù)的研發(fā)和應(yīng)用推廣服務(wù)的高新技術(shù)企業(yè)。2016年成立了“廣州市輝園苑精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院”。公司以“技術(shù)創(chuàng)新,共同發(fā)展” 為理念,致力于為生命科學(xué)研究、生物技術(shù)、醫(yī)學(xué)制藥等產(chǎn)業(yè)的發(fā)展提供全方位、 高質(zhì)量的技術(shù)服務(wù),公司極重視與臨床研究相關(guān)的課題合作,并為臨床提供高效實 用的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)解決方案,與醫(yī)院、研究所和高校均有課題對接,共同孵化高水平科研成果。


? ? ? ?經(jīng)過5年的沉淀與發(fā)展,公司現(xiàn)擁有分子克隆(載體構(gòu)建,PCR,甲基化檢測等)、病毒包裝、細(xì)胞實驗(穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建、Transwell、流式凋亡、流式周期、平板克隆 等)、表觀遺傳檢測(雙熒光素酶報告基因檢測,CHIP,CO-IP,EMSA等)、生化檢測、動物實驗(動物模型構(gòu)建、藥理、毒理實驗)、分子病理(共聚焦、IF,F(xiàn)ISH 等)、超微病理(電鏡)等技術(shù)平臺,并榮獲“知識產(chǎn)權(quán)管理體系認(rèn)證證書”。平臺專注為科研工作者提供整體科研服務(wù)并提供轉(zhuǎn)化一體化解決方案,已協(xié)助完成多項國自 然面上項目。公司擁有專業(yè)的實驗技術(shù)人才、生信分析團(tuán)隊及經(jīng)驗豐富的學(xué)術(shù)管家團(tuán)隊,團(tuán)隊碩、博士以上學(xué)歷員工占比超過40%,團(tuán)隊骨干主導(dǎo)申報多項973及國自然 項目,具備豐富的科研經(jīng)驗。


? ? ? ?公司先后申請國家專利10項,已授權(quán)3項,2017年認(rèn)定為“廣東省高新技術(shù)企業(yè)”,2018年“易細(xì)胞”、“基因技術(shù)實驗檢測服務(wù)”、“胎牛血清”認(rèn)定為高新技術(shù)產(chǎn)品。并與 哈佛大學(xué)、廣州市第一人民醫(yī)院、中山大學(xué)及其附屬醫(yī)院、南方醫(yī)科大學(xué)及其附屬醫(yī)院、廣州醫(yī)科大學(xué)及附屬醫(yī)院、廣東省人民醫(yī)院、廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院、廣東省中醫(yī)院、 深圳市人民醫(yī)院、廣西中醫(yī)藥大學(xué)、貴州省人民醫(yī)院、同濟(jì)醫(yī)院、上海市同仁醫(yī)院等近百家大中型科研院所建立密切的聯(lián)系,開展技術(shù)服務(wù)及產(chǎn)學(xué)研合作。


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