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腸道菌群研究方案設(shè)計匯總
2019.12.02
1375次

? ? ? 本月初,治療阿爾茨海默病新藥——九期一上市的消息引爆了我們生物醫(yī)藥人的朋友圈,但業(yè)內(nèi)專業(yè)人士就“藥物作用機理闡釋不明”“Ⅲ期臨床試驗周期過短”“效果評估依據(jù)不充分”等問題提出了質(zhì)疑。


? ? 無論這款藥有用與否、關(guān)于它的質(zhì)疑是真是假,其實小編都不在意。作為更關(guān)注科研的小編,注意到的一點是,該藥物作用原理是通過改變腸道微生物組來改善AD患者的認知功能。


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? ? ? 腸道微生物又一次重磅出現(xiàn)在了人們的視線中!

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? ? ? 眾所周知,腸道菌與人體的很多疾病相關(guān),目前這一塊的研究熱度依然不減。

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? ? ? 今天小編就帶大家一起熟悉一下腸道菌的研究套路,希望能給正在寫國自然或省自然、碩士開題或博士科研計劃書的你帶來一點點幫助。

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? ? ? 研究菌群與疾病,從整體上看,無外乎三種模式:關(guān)聯(lián)關(guān)系探究、因果關(guān)系探究和應(yīng)用菌群干預(yù)疾病的研究。其實這三點即獨立也相互關(guān)聯(lián)。

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一、疾病與菌群關(guān)聯(lián)關(guān)系類研究


? ? ? 01?特征菌群類研究


? ? ? 此類研究目的主要是客觀地描述人體菌群組成的特征,解釋某種疾病或現(xiàn)象與其共生菌群的關(guān)系。

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? ? ? 研究思路:

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? ? ? 此類研究方法相對比較簡單,設(shè)立疾病組和健康組,通過大樣本量對比研究,確定特定人群的特征微生物組成。目前此類文章已經(jīng)發(fā)表了很多很多,幾乎各種疾病與腸道菌群的關(guān)系都有涉及,如今想發(fā)高分文章,選題角度一定要新穎,而且一般需要的樣本量較大,最好能再結(jié)合代謝組學(xué)等其他組學(xué)做多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析,在找到差異菌群的同時,對差異的代謝通路進行關(guān)聯(lián)分析,這樣文章相對比較容易上檔次。


? ? ? 02?菌群影響因素類研究


? ? ? 影響腸道菌群的因素有很多:遺傳、生活方式、飲食習(xí)慣、運動、生活環(huán)境等都是影響腸道菌群平衡的重要原因。


? ? ? 例如:對新生嬰兒菌群組成影響因素的研究,比如分娩方式、孕期飲食、喂養(yǎng)方式(母乳、提前添加輔食、配方奶粉)、早產(chǎn)兒等,研究對嬰兒腸道菌群影響的因素,對后續(xù)指導(dǎo)和維護嬰兒健康有重要的作用。

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二、疾病與菌群因果關(guān)系類研究


? ? ? 01?細菌功能驗證及疾病機理研究


? ? ? 潛在致病菌或有益菌的功能驗證及疾病機理研究思路:

? ? ? 1.確定一種或幾種目標菌,利用動物實驗對該菌進行驗證,通過分析臨床理化指標,探討該菌與疾病的關(guān)系。

? ? ? 2.收集處理后動物模型糞便樣本,測序,探討該菌如何影響腸道菌群致病或改善疾病;

? ? ? 3.結(jié)合臨床指標、理化結(jié)果、微生物結(jié)果,綜合分析作用機制。

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? ? ? 02?疾病的發(fā)生發(fā)展與菌群相關(guān)性研究


? ? ? 研究思路:

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三、菌群干預(yù)類研究


? ? ? 腸道菌群研究常用的干預(yù)手段:


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研究思路:

? ? ? 1.研究治療手段(不同藥物干預(yù)、同藥物不同劑量干預(yù)、干預(yù)不同天數(shù)、益生菌、糞菌移植等)對疾病的治療效果(臨床指標、理化指標等),基于臨床指標判斷治療效果;

? ? ? 2.比較疾病組、疾病干預(yù)組、及健康對照組微生物組成的差異;

? ? ? 3.驗證治療手段是否是通過改變菌群后治療效果。

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? ? ? 今天的分享主要是講思路,沒有講具體的方法,其實現(xiàn)在研究腸道菌群的方法無外乎16S rRNA測序/宏基因組學(xué)測序+代謝組學(xué),可以說這是目前最流行的做法了。代謝組學(xué)相對更接近表型,基因測序與代謝組學(xué)的結(jié)合,能夠更全面的闡述深層次的機制問題。



往期相關(guān)鏈接:

? ? ? Nature Medicine|腸道菌群與早衰,高分文章解析

? ? ? Gastroenterology:腸道菌群與結(jié)腸癌高分文章研究思路

? ? ? C位出道的腸道菌群

? ? ? 博士苑科研思路總結(jié):腸道菌群相關(guān)疾病研究整體方案

? ? ? 這個熱點了解一下!2018年腸道菌群相關(guān)國自然基金分析

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